Os eucariontes não são classificados como separados dos procariontes quando formam colônias de procariontes. Eucariontes e procariontes são dois domínios distintos da vida, caracterizados por estruturas celulares e histórias evolutivas fundamentalmente diferentes. Procariontes são organismos unicelulares que não possuem um núcleo ligado à membrana e outras organelas ligadas à membrana. Em contraste, os eucariontes incluem todos os organismos com núcleos e organelas ligados à membrana, abrangendo uma ampla gama de organismos, desde protistas a animais, plantas e fungos.

Quando múltiplas células procarióticas coexistem próximas ou formam arranjos coloniais, elas não formam células eucarióticas nem constituem eucariotos. Estas colónias ou agregados de células procarióticas ainda se enquadram no domínio procariótico, pois mantêm os traços estruturais e genéticos característicos dos procariontes. Por outro lado, as células eucarióticas são distintas e distintas das colônias procarióticas em termos de complexidade celular, componentes celulares e origens evolutivas.