O instrumento usado no estudo das células é chamado de microscópio. Os microscópios são usados para ampliar pequenos objetos, permitindo aos cientistas observar a estrutura e a função das células. Existem muitos tipos diferentes de microscópios, cada um com suas vantagens e desvantagens. O tipo mais comum de microscópio é o microscópio óptico, que usa luz visível para ampliar objetos. Os microscópios ópticos podem ampliar objetos em até 1.000 vezes. Outro tipo de microscópio é o microscópio eletrônico, que usa um feixe de elétrons para ampliar objetos. Os microscópios eletrônicos podem ampliar objetos até 1 milhão de vezes.