As sequências móveis de DNA, também conhecidas como elementos transponíveis, utilizam vários mecanismos para encontrar seus locais alvo para inserção. Os mecanismos específicos podem variar dependendo do tipo de elemento transponível e do genoma hospedeiro em que reside. Aqui estão algumas estratégias gerais empregadas por sequências de DNA móvel para encontrar suas regiões alvo:
1. Repetições Terminais Invertidas (TIRs):Muitos elementos transponíveis, como transposons de DNA, possuem repetições terminais invertidas (TIRs) em suas extremidades. Os TIRs atuam como sequências de reconhecimento que são especificamente ligadas pelas enzimas transposases. As transposases podem reconhecer e ligar-se aos TIRs, facilitando a integração do elemento transponível no genoma do hospedeiro.
2. Duplicações de sítios-alvo (TSDs):Alguns transposons, como retrotransposons, geram duplicações de sítios-alvo (TSDs) após sua integração. TSDs são repetições curtas e diretas que flanqueiam o elemento transponível inserido. As transposases envolvidas na retrotransposição podem reconhecer e inserir o elemento transponível em regiões com motivos específicos de sequência de DNA ou características estruturais que permitem uma integração eficiente.
3. Reparo Dirigido por Homologia (HDR):Certas sequências de DNA móvel, particularmente retrotransposons conhecidos como LINEs (Long Interspersed Nuclear Elements), podem utilizar mecanismos de reparo dirigido por homologia (HDR) para encontrar seus locais alvo. O HDR permite a integração precisa de sequências de DNA em regiões específicas do genoma hospedeiro com base na homologia de sequências. Os LINEs podem usar suas próprias sequências internas ou sequências de outras regiões genômicas como modelos para HDR, permitindo a inserção direcionada.
4. Priming de alvo:Alguns retrotransposons, como SINEs (Elementos Nucleares Intercalados Curtos), usam um processo chamado priming de alvo para inserção. A iniciação do alvo envolve a enzima transcriptase reversa do retrotransposon que varre o genoma do hospedeiro em busca de sequências específicas, como genes de tRNA ou outros elementos SINE. A transcriptase reversa utiliza então estas sequências como iniciadores para iniciar a transcrição reversa do elemento transponível, levando à sua integração no local iniciado.
5. Acessibilidade da cromatina:A acessibilidade das regiões da cromatina também influencia o direcionamento das sequências de DNA móvel. As enzimas transposase podem exibir preferências para integração em regiões de cromatina abertas ou acessíveis, onde o DNA é menos compactado. Isto permite uma inserção e integração mais eficiente do elemento transponível no genoma do hospedeiro.
É importante notar que os mecanismos de direcionamento das sequências de DNA móvel podem ser complexos e variar entre diferentes classes e famílias de elementos transponíveis. As preferências e mecanismos de direcionamento específicos também podem evoluir ao longo do tempo, contribuindo para a diversidade e dinâmica das inserções de elementos transponíveis no genoma do hospedeiro.
