As moléculas de DNA se movem através de nanoporos sob uma voltagem aplicada, um fenômeno fundamental para o sequenciamento de DNA e outras aplicações em nanobiotecnologia. Apesar de muitos estudos experimentais e computacionais, o mecanismo detalhado da translocação do DNA permanece obscuro. Aqui empregamos simulações de dinâmica molecular atomística de longa data em conjunto com experimentos de translocação para elucidar a dinâmica de descompactação. Simulações revelam que a translocação de uma única molécula de DNA é mediada por uma dinâmica coletiva de múltiplos pares de bases que interagem cooperativamente com a superfície do nanoporo. A dinâmica de descompactação exibe rajadas intermitentes, levando à translocação de bases de DNA com um tamanho de passo de 0,34 nm, que é metade do passo do DNA de fita dupla. Esta descoberta resolve o debate de longa data sobre se o tamanho da etapa de translocação do DNA é 0,34 nm ou 0,68 nm. Nossos resultados revelam os detalhes atomísticos do mecanismo de translocação e fornecem informações sobre o projeto de dispositivos baseados em nanoporos para análise e manipulação de DNA.