p Cientistas de todo o mundo estão correndo para encontrar inibidores de SARS-CoV-2, o novo coronavírus por trás da pandemia COVID-19. Alguns estão usando simulações de computador para identificar compostos promissores antes de conduzir experimentos reais no laboratório. Agora, pesquisadores relatando em ACS Nano usaram modelagem de computador para avaliar quatro peptídeos que imitam o domínio de ligação ao vírus da proteína humana que permite que o SARS-CoV-2 entre nas células. p Para infectar células, O SARS-CoV-2 usa sua proteína de pico para se ligar ao receptor ACE2, uma proteína na superfície de certas células humanas. Esse anexo permite que o vírus se funda com a membrana da célula hospedeira e ganhe entrada. Muitos pesquisadores têm tentado encontrar compostos que bloqueiem regiões-chave da proteína do pico, impedir que o vírus infecte as células. Yanxiao Han e Petr Král queriam usar modelagem de computador para projetar compostos que imitassem o alvo natural da proteína de pico, ACE2.

p Para fazer isso, os pesquisadores examinaram a estrutura de cristal de raios-X recentemente publicada do domínio de ligação ao receptor do SARS-CoV-2 quando está ligado ao ACE2. Eles identificaram 15 aminoácidos da ACE2 que interagem diretamente com a proteína viral. Então, os pesquisadores desenvolveram quatro inibidores que contêm a maioria ou todos esses aminoácidos, com sequências adicionais que eles pensaram que estabilizariam as estruturas. Por meio de simulações de computador, a equipe estudou como os inibidores podem se ligar à proteína spike no corpo e as energias necessárias para a ligação. Um dos compostos mostrou um ajuste particularmente bom com a proteína viral. O peptídeo ainda precisa ser testado em laboratório e em pacientes, mas ser capaz de restringir candidatos a medicamentos no computador pode ajudar a acelerar esse processo, a equipe diz.