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  • Um novo olhar sobre as nanomáquinas de proteínas
    p As características nano-mecânicas essenciais das proteínas podem ser convenientemente estudadas por uma geometria simplificada. Tirando, por exemplo, um cilindro, e pedindo «evolution »para encontrar um canal de fluido (mostrado em azul), uma infinidade de propriedades realistas de proteínas reais aparecem naturalmente, e exibem a vantagem de conceitual, em vez de modelos detalhados de proteínas. Crédito:© UNIGE - Jean-Pierre Eckmann

    p As proteínas digerem os alimentos, e combater infecções e câncer, e servem a outras funções metabólicas. Eles são basicamente nanomáquinas, cada um projetado para realizar uma tarefa específica. Mas como eles evoluíram para atender a essas necessidades, e como os genes codificam a estrutura e função das proteínas? Pesquisadores da Universidade de Genebra (UNIGE), Suíça, o Institute for Basic Science, Coréia, e a Universidade Rockefeller, NÓS., conduziram um estudo que aborda essa questão e explica a geometria básica do código de gene para proteína conectando proteínas a propriedades de matéria física amorfa. p O artigo completo aparece em Revisão Física X .

    p Uma proteína é uma cadeia feita de 20 tipos diferentes de aminoácidos com interações elaboradas, e ao contrário da matéria física padrão, as proteínas são selecionadas pela evolução. "O projeto para a síntese de proteínas é escrito em genes de DNA longos, mas mostramos que apenas uma pequena fração desse enorme espaço de informações é usada para fazer a proteína funcional, "explica Jean-Pierre Eckmann, Professor do Departamento de Física Teórica da Faculdade de Ciências da UNIGE.

    p Juntamente com o Prof. Tsvi Tlusty do Center for Soft and Living Matter, Institute for Basic Science (IBS) na Coreia e o Prof. Albert Libchaber da Rockefeller University em Nova York, O professor Eckmann mostra que as únicas mudanças no código que importam são aquelas que ocorrem no segmento do gene que codifica as dobradiças mecanicamente relevantes da nanomáquina. As mudanças em outras regiões deste código altamente redundante não têm impacto. "Agora estamos usando essa nova abordagem para entender a relação entre a função e a dinâmica de várias proteínas importantes."


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