A identificação de tipos de madeira petrificada pode ser uma tarefa difícil e às vezes impossível. Algumas peças de madeira perdem tanto de sua estrutura celular original durante o processo de petrificação que é impossível recuperar informações suficientes para identificá-las. Alguns tipos de madeira são distintos o suficiente para que os novatos possam reconhecê-los com apenas uma lupa de 10x. Até as melhores amostras de algumas espécies de madeira precisam de treinamento e equipamento de alta ampliação para identificar.
Primeiras pistas

A qualidade da madeira determinará se a peça pode ser identificada. A estrutura celular original às vezes é completamente destruída pelo processo de petrificação. Se você pode ver padrões na madeira, há uma boa chance de a peça ser identificada. Saber que tipos de árvores crescem nas áreas em que a madeira foi encontrada também não ajuda a identificar sua peça. Se um espécime pode ser reduzido a algumas possibilidades, alguns tipos podem ser descartados porque provavelmente não seriam encontrados com espécies conhecidas dessa área. O restante do processo de identificação requer ampliação.
Estruturas celulares

Algumas estruturas celulares são evidentes com ampliação de apenas 10x. Outros podem precisar de uma ampliação de até 800x. Células (traqueídeos) de diferentes classes de madeira são organizadas em diferentes padrões. Por exemplo, ao olhar através da madeira como faria ao ver anéis de crescimento, uma árvore de coníferas possui pequenas células redondas que formam linhas bastante retas. Os angiospermas (carvalho, nogueira, sicômoro) têm vasos em vez de traqueídeos, que são semelhantes, mas não formam fileiras bem organizadas nem sempre são redondos. O ginkgo ainda possui uma formação celular diferente da do milho. É necessário conhecer a estrutura celular de diferentes formas de madeira para identificação adequada.
Raios e outras características distintivas

Os raios são indicadores importantes dos tipos de madeira. Raios são linhas de pequenas células que vão do centro da ronda até a casca. Em alguns tipos de madeira, esses raios são finos, às vezes com apenas uma ou duas células de largura, e em outros são mais largos ou de larguras diferentes. Árvores frutíferas têm muitas larguras de raios, enquanto o pinheiro possui raios estreitos e uniformes. Algumas madeiras têm outras características distintivas. O pinho, por exemplo, tem "dutos de resina". Esses ductos parecem células, mas são muito maiores. Se eles são encontrados em madeira com pequenas linhas retas de células e raios estreitos, não é necessário um exame mais aprofundado para saber que a madeira é pinheiro.
Métodos de Exame

O exame geralmente é feito com um cubo de madeira. para que possa ser visto de diferentes ângulos do eixo. Os cubos de madeira são lixados finamente para remover arranhões que podem dificultar a identificação. Se forem necessários altos níveis de ampliação, são usadas fatias finas de madeira com apenas algumas células de espessura. O examinador deve conhecer os aspectos das diferentes madeiras, para que também haja alguma educação envolvida no processo. A tecnologia está facilitando a identificação com software que pode ajudar no processo de identificação. Este software pode ser adquirido on-line por qualquer pessoa que deseje buscar o campo da identificação de madeira fossilizada.