No século XIX, a taxonomia - a classificação dos organismos vivos - era toda a raiva da biologia. [ref. 1] Ambos os naturalistas amadores e profissionais estavam tão envolvidos na mania de colecionar e identificar criaturas, besouros raros eram commodities quentes. [ref.2, sobre o meio do caminho para baixo] Na época, pouco se sabia sobre microorganismos e seu lugar no mundo dos seres vivos, então eles não receberam tanta atenção. As décadas seguintes viram um aumento dramático no conhecimento de micróbios, com parte desse aumento demonstrado pela classificação eficiente de microrganismos.
Taxonomia
A taxonomia tem três componentes: nomenclatura, classificação e identificação. Nomenclatura é simplesmente atribuir um nome a uma espécie. A classificação é agrupar espécies de acordo com características compartilhadas - algumas das quais são físicas e algumas bioquímicas. A identificação está usando características de um organismo para determinar onde ele pertence em um esquema de classificação. O esquema taxonômico moderno tem como seu maior e mais abrangente grupo os domínios. O menor grupo é a espécie. Do mais inclusivo ao mais específico, os níveis funcionam assim: domínio, reino, filo, classe, ordem, família, gênero e espécie. Você, por exemplo, é Eukarya Animalia Chordata Mamíferos Primata Hominidae Homo sapiens.
Microrganismos e Domínios
Os microorganismos são extremamente diversos. Eles não são definidos por nenhum tipo particular de estrutura ou função, mas simplesmente pelo seu tamanho. Os microorganismos são tão diversos que se enquadram nas três diferentes classificações de alto nível - todos os três domínios. Um domínio é bactéria, o outro é archaea e o final é eucariota. Todos os membros dos domínios bactérias e archaea são microorganismos unicelulares. Ambas são células sem membranas que separam seu material genético do resto da célula - membranas que definem um núcleo. Assim, todos os reinos, filos, classes, ordens, famílias, gêneros e espécies dentro dos domínios de bactérias e archaea são microorganismos.
Protistas
Eucárias são organismos cujas células contêm um núcleo. Muitos organismos eucarióticos são microrganismos unicelulares, mas muitos outros - como sequóias, ou você - não são. Portanto, classificações adicionais são necessárias. O reino Protista dentro do domínio Eukarya é composto de apenas microorganismos unicelulares. Os protistas são separados em três grupos diferentes de filos: quatro diferentes filos de algas, quatro diferentes filos de protozoários e dois diferentes filos de moldes. Mas todos os organismos dentro desses filos - todos dentro do reino Protista - são microorganismos.
Fungi
O reino Fungi está contido dentro do domínio Eukarya. Alguns dos filos dentro dos fungos contêm microorganismos. Por exemplo, o filo Zygomycota contém moldes de pão microscópicos, e o filo Ascomycota contém leveduras e pragas e parasitas de culturas microbianas. Os líquenes são uma assembleia simbiótica de um fungo e um organismo fotossintético - contido parcialmente dentro do reino Fungos e parcialmente em outros reinos, ou mesmo em outros domínios.
