Honduras é a segunda maior nação da América Central, estendendo-se pelo istmo do Caribe até o Pacífico. Apesar do desmatamento agressivo, Honduras ainda mantém mais áreas florestais do que a maioria dos outros países da região. Diversos tipos de floresta dominam a paisagem, incluindo floresta nublada, floresta de pinheiros, floresta tropical e manguezais. Espécies vegetais e animais são abundantes nos diversos ecossistemas florestais de Honduras, incluindo espécies que desapareceram do resto da região.

Mamíferos

Mais de 200 espécies de mamíferos são encontradas nas florestas de Honduras. Os morcegos (Chiroptera) respondem por quase metade dos mamíferos do país, com 98 espécies conhecidas ocupando todos os ecossistemas florestais. O icônico jaguar (Panthera onca) é uma das espécies mais raras de toda a América Central. Mais freqüentemente visto em áreas de mangue, as onças são uma espécie em extinção em Honduras. O peixe-boi das Índias Ocidentais (Trichechus manatus), uma vez comum ao longo da costa caribenha de Honduras, é agora raramente visto, exceto em áreas remotas de mangue. O animal nacional de Honduras, o veado-de-cauda-branca (Odocoileus virginianus), é a maior espécie de cervo do país. Mais frequentemente visto nas planícies e florestas de pinheiros, o cervo de cauda branca é uma espécie protegida. Uma grande variedade de macacos também é encontrada em Honduras, incluindo o macaco-prego (Cebus capucinus), o macaco-aranha mexicano (Ateles geoffroyi vellerosus) e o bugio-dourado (Alouatta palliata palliata).

Pássaros

Honduras possui uma diversidade excepcionalmente rica de espécies de aves. Existem 18 espécies de papagaios, incluindo o periquito-de-queixo-laranja (Brotogeris jugularis), a grande arara verde (Ara ambigua), o periquito-do-Pacífico (Aratinga strenua) e a arara vermelha (Ara macao), ave nacional de Honduras. Encontrada em florestas tropicais de altitude, a andorinha-preta (Notiochelidon pileata) é uma ave migratória comum em Honduras. O tucano-castanheiro (Ramphastos swainsonii) é uma visão freqüente nas florestas costeiras de terras baixas de Honduras. Conhecido por seu rosto colorido e conta exagerada, às vezes são mantidos como animais de estimação, apesar de ser uma espécie protegida.

Árvores

Cada ecossistema florestal tem uma espécie-chave, significando que uma espécie define a floresta tipo. Em Honduras, os manguezais negros (Avicennia germinans) e os manguezais vermelhos (Rhizopora mangle) indicam os limites do ecossistema manguezal. As árvores de mogno (Swietenia macrophylla) são por vezes misturadas com espécies de mangal em terra seca, indicando o início das florestas costeiras de pinhal. Pinho das Honduras (Pinus caribaea var. Hondurensis) e pinheiro oco (Pinus oocarpa) são as duas únicas espécies de pinus do país, embora dominem grandes extensões de floresta de várzea. Uma das árvores mais impressionantes de Honduras é a Ceiba (Ceiba pentandra). Às vezes chamado de sumaúma, é uma árvore maciça que pode chegar a 250 metros de altura com um tronco de 10 pés de diâmetro.

Plantas de floração

Cientistas estimam que existem mais de 5.000 espécies de plantas em Honduras. As plantas florescentes são abundantes na maioria das áreas do país, onde fornecem alimento para espécies de insetos e aves. Uma das espécies de plantas mais prolíficas em Honduras é a sálvia (Salvia). A sálvia do pêssego (Salvia dorisiana), a sálvia de Karwinski (S. karwinskii) e a sálvia azul (Salvia cacaliifolia) são todas espécies perenes e arbustivas que florescem nas florestas frescas e montanhosas do centro de Honduras. Antes uma fonte de alimento para os povos indígenas, o lótus amarelo (Nelumbo lutea) é uma das poucas plantas com flores encontradas nas florestas de mangue. Conhecida por suas flores amarelas em forma de taça, muitas vezes é cultivada em jardins de água como planta ornamental.