Em uma cruz de dois fatores, Mendel seguiu a herança de duas características diferentes simultaneamente.

Por exemplo, ele cruzou as plantas de ervilha que diferiam na cor da semente (amarelo verde verde) e na forma de semente (redonda versus enrugada). Ao observar a prole, ele foi capaz de deduzir a variedade independente dessas características, o que significa que os alelos para uma característica (como a cor das sementes) são herdados independentemente dos alelos para a outra característica (forma de semente).