As ligações de hidrogênio são geralmente mais fortes do que as ligações coordenadas. As ligações de hidrogênio são formadas entre um átomo de hidrogênio e um átomo eletronegativo, como nitrogênio, oxigênio ou flúor. O átomo eletronegativo atrai os elétrons na ligação de hidrogênio, criando uma carga parcial positiva no átomo de hidrogênio e uma carga parcial negativa no átomo eletronegativo. Essa atração eletrostática é o que mantém unida a ligação de hidrogênio.

As ligações coordenadas, também conhecidas como ligações dativas, são formadas quando um átomo doa um par de elétrons para outro átomo. O átomo que doa os elétrons é chamado de base de Lewis, e o átomo que aceita os elétrons é chamado de ácido de Lewis. As ligações coordenadas são mais fracas que as ligações de hidrogênio porque a atração eletrostática entre os dois átomos é mais fraca. Isso ocorre porque os elétrons em uma ligação coordenada não são compartilhados igualmente entre os dois átomos, como ocorre em uma ligação de hidrogênio.

Em geral, as ligações de hidrogênio são cerca de 10 vezes mais fortes que as ligações coordenadas. No entanto, a força de uma ligação de hidrogênio ou de uma ligação coordenada pode variar dependendo dos átomos específicos envolvidos.