As ligações de hidrogênio só podem se formar quando o átomo está envolvido em uma ligação covalente polar, onde há uma diferença significativa na eletronegatividade entre os átomos ligados. Esta diferença na eletronegatividade cria uma carga parcial positiva no átomo de hidrogênio e uma carga parcial negativa no átomo mais eletronegativo, permitindo a formação de ligações de hidrogênio.