Derivada de organismos vivos ou recentes, ou biomassa, a composição básica dos biocombustíveis é mais complexa do que a composição dos combustíveis fósseis. Enquanto os combustíveis fósseis consistem apenas em átomos de carbono e hidrogênio, ou hidrocarbonetos, os biocombustíveis contêm átomos de oxigênio, e sua composição química pode incluir ácidos, álcoois e ésteres. O biobutanol é derivado da biomassa ou produzido por fermentação usando organismos encontrados em animais ruminantes e solos. A composição básica do butanol consiste em C (carbono), H (hidrogênio) e O (oxigênio). A fórmula química da molécula de butanol é C4H10O. O biobutanol fornece mais energia que o etanol e pode ser misturado com gasolina para ajudar a reduzir os gases de efeito estufa. Qualquer carro movido a gasolina pode funcionar com uma mistura de bio-butanol. Derivado de óleos vegetais e gorduras animais, as moléculas de biodiesel são ésteres de ácidos graxos de cadeia longa contendo cadeias simples de 12 a 24 átomos de carbono. Os ésteres contêm um álcool e um ácido carboxílico. O ácido carboxílico contém COOH (carboxil) e o álcool contém OH (hidróxido). O biodiesel queima mais do que o diesel tradicional, produzindo menos enxofre e menos partículas. O biodiesel libera um pouco menos de energia do que o diesel à base de petróleo, e é mais corrosivo para as peças do motor. Etanol Derivado do milho, beterraba sacarina e cana-de-açúcar, outras fontes de produção de etanol, como milho stover e switchgrass estão em desenvolvimento. Contendo carbono, hidrogênio e um grupo de hidróxido, a fórmula química da molécula de etanol é C2H5OH. Qualquer veículo vendido nos Estados Unidos pode rodar no E10, uma mistura de 10% de etanol e 90% de gasolina sem chumbo. Fornecendo cerca de 50% da energia da gasolina, a combustão do etanol é mais limpa e produz menos monóxido de carbono, mas produz mais poluição. Metanol O mais simples dos álcoois, o metanol pode ser derivado de qualquer planta. material, bem como gás de aterro, emissões de usinas de energia e dióxido de carbono atmosférico. A composição básica do metanol consiste em carbono, hidrogênio e hidróxido. A fórmula química para a molécula de etanol é CH3OH. A combustão do metanol produz um volume menor de toxinas do que a gasolina, menos partículas e menos poluição. O metanol é mais barato que a gasolina ou o etanol, e o custo de modificar um veículo para funcionar com misturas de metanol é baixo.