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    Açúcares de DNA caracterizados em resolução sem precedentes, átomo por átomo

    À esquerda, as estruturas são completamente isoladas de qualquer agente externo (solvente, agrupamento cristalino) e à direita, as estruturas na água. Na estrutura mais abundante, os pontos sólidos indicam as posições determinadas experimentalmente para cada átomo. Crédito:Emilio J. Cocinero

    Um trabalho de pesquisa conduzido pelo Grupo de Espectroscopia do Departamento de Físico-Química da UPV / EHU, e o Instituto Biofisika fornece a capa da última edição do ACS Central Science Diário, que é um dos três principais periódicos da química. Este grupo de pesquisa conseguiu determinar a estrutura dos açúcares que fazem parte do DNA, 2-desoxirribosídeo, com resolução de nível atômico. O que foi alcançado aqui é "uma resolução sem precedentes; conseguimos posicionar espacialmente cada um dos átomos deste açúcar, "conforme descrito pelo líder do grupo Emilio J. Cocinero.

    Cocinero considera este resultado o culminar de um trabalho que os leva ao longo de dez anos:“Este resultado foi possível graças ao aumento da sensibilidade do espectrômetro de microondas que temos em nosso grupo, que nós projetamos, construímos e adaptamos e que neste momento está entre os 3 melhores aparelhos deste tipo no mundo. "

    Um dos principais obstáculos que eles tiveram que superar foi a enorme variabilidade e flexibilidade entre as várias formas ou conformações que podem ser adotadas pelas moléculas de 2-desoxirribosídeo. Os átomos que formam essas moléculas de açúcar podem ser organizados formando anéis de cinco ou seis membros. "Na natureza, formas biológicas exibem anéis de cinco membros, mas nos experimentos em que o açúcar é completamente isolado e removido de qualquer solvente e sem interagir com os demais elementos que compõem o DNA e determinam sua configuração, a forma mais estável de açúcares que estávamos alcançando eram anéis de seis membros, "explicou Cocinero.

    Para resolver esta situação eles contaram com a colaboração de pesquisadores do Departamento de Química da Universidade de Oxford que os ajudaram a sintetizar as quatro formas que os 2-desoxirribosídeos podem adotar, tanto em suas formas biológicas quanto naquelas que não aparecem na natureza, e eles os bloquearam, "adicionando um grupo metil aos açúcares para evitar que algumas formas se interconvertam em outras, e ser capaz de estudar cada um deles individualmente, "especificou o pesquisador.

    Dessa maneira, conseguiram caracterizar de forma isolada a estrutura de cada um deles em escala atômica, e posteriormente, com a ajuda de pesquisadores da Universidade de La Rioja, puderam analisar como a estrutura dessas formas se altera ao entrar em contato com o solvente, "que é mais parecido com o meio natural em que são normalmente encontrados. Vimos as diferenças entre algumas formas e outras e as caracterizamos."

    Essa análise também permitiu que eles levantassem a hipótese "por que a forma que é observada na natureza é aquela que é observada e não outra. Como vimos, a forma de anel de cinco membros é mais flexível e a conformação que adota na cadeia de DNA incentiva a ligação dos nucleotídeos consecutivos, " ele disse.

    Agora, armados com os instrumentos que desenvolveram, eles vão abordar "o estudo de moléculas maiores e tentar construir sistemas cada vez mais próximos das formas biológicas reais para fornecer melhores respostas. Estamos buscando o limite dos instrumentos técnicos, "concluiu Emilio J. Cocinero.


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