Os pacientes querem ver suas informações médicas. Os pesquisadores querem compartilhar seus dados.

Agora, cientistas da Scripps Research lançaram uma nova tecnologia projetada para tornar essas medições mais fáceis de realizar e mais acessíveis aos profissionais, cientistas e o público em geral.

"Na verdade, trata-se de compartilhar dados e acelerar o processo de descoberta, "diz Gary Siuzdak, Ph.D., professor da Scripps Research e co-autor correspondente da nova plataforma de análise de dados abertos XCMS / METLIN, publicado recentemente em Métodos da Natureza .

XCMS-MRM e METLIN-MRM representam uma plataforma de análise baseada em nuvem que permite aos cientistas quantificar moléculas de amostras biológicas e disponibilizar seus resultados publicamente.

"Quando dizemos 'disponível publicamente, 'nós queremos dizer isso. Qualquer pessoa com um computador teria acesso, "diz Siuzdak.

Dirigido por Siuzdak, o Center for Metabolomics and Mass Spectrometry da Scripps Research é especializado no uso de uma técnica chamada espectrometria de massa para identificar e quantificar pequenas moléculas, sejam eles drogas ou metabólitos de ocorrência natural. Os metabólitos são essenciais, pois interagem com todos os níveis da fisiologia de uma pessoa:o genoma, transcriptoma e o proteoma. Pode-se dizer que os metabólitos são manipuladores mestres da fisiologia e refletem a assinatura de saúde de um indivíduo.

Dezenas de milhares de laboratórios em todo o mundo geram dados usando espectrometria de massa, então a plataforma também pode ser útil fora da medicina, dizem os primeiros autores do estudo Xavier Domingo-Almenara, Ph.D., e J. Rafael Montenegro-Burke, Ph.D., da Pesquisa Scripps. Qualquer campo usando espectrometria de massa pode se beneficiar desses novos recursos, como ciências ambientais, farmacêuticos, forense, controle de alimentos e medicina esportiva, eles acrescentam.

Siuzdak e seus colegas há muito buscam manter suas ferramentas de pesquisa gratuitas e abertas ao público. Paul Benton, Ph.D., analista de bioinformática da Scripps Research e co-autor do estudo, explica que hospedar sua plataforma na nuvem permite que qualquer pessoa, de colaboradores a pacientes, para verificar a validade dos resultados da espectrometria de massa. "Em uma época em que os resultados científicos são constantemente questionados, os dados abertos se tornaram uma parte essencial do processo de descoberta, “Diz Benton.

A ideia de compartilhamento aberto de dados se popularizou nos últimos anos. Desde seu lançamento em 2004, a plataforma XCMS / METLIN cresceu para mais de 25, 000 usuários, e as moléculas em seu repositório de dados saltaram de 14, 000 a 150, 000 apenas no ano passado, em parte graças a uma colaboração com a Calibr, uma divisão da Scripps Research.

Os novos recursos aproveitam as inovações que permitem aos cientistas acelerar a pesquisa - e aumentar a precisão - ao identificar os fragmentos-chave de uma molécula que os diferencia.

"Não há nada mais perto disso, "Siuzdak diz.

O estudo, "XCMS-MRM e METLIN-MRM:uma biblioteca em nuvem e recurso público para análise direcionada de pequenas moléculas, "incluiu autores adicionais da Universidade de Lausanne; Lausanne University Hospital, Hospitais da Universidade de Genebra; Universidade de Umeå e Imperial College London.