Existem várias ferramentas e métodos usados para comparar a anatomia dos organismos e inferir suas relações evolutivas, apontando para um possível ancestral:

1. Estruturas homólogas: São estruturas que compartilham uma origem comum, mesmo que tenham funções diferentes. Por exemplo, a asa de um morcego, a barbatana de uma baleia e o braço humano compartilham a mesma estrutura óssea básica, sugerindo um ancestral comum.

2. Estruturas vestigiais: Estas são estruturas reduzidas ou não funcionais funcionais em organismos ancestrais. Por exemplo, o apêndice em humanos é uma estrutura vestigial que provavelmente era maior e mais funcional em nossos ancestrais herbívoros.

3. Embriologia comparativa: Comparar o desenvolvimento embrionário de diferentes organismos pode revelar semelhanças que não estão presentes nos adultos. Por exemplo, todos os embriões de vertebrados têm fendas branquiais em algum momento de seu desenvolvimento, sugerindo um ancestral aquático compartilhado.

4. Dados moleculares (genética): A comparação de sequências de DNA e proteína pode fornecer um método muito detalhado e poderoso para inferir relacionamentos evolutivos. Quanto mais semelhantes as seqüências de DNA, mais intimamente relacionados os organismos.

5. Biogeografia: A distribuição geográfica dos organismos também pode fornecer pistas sobre sua história evolutiva. Por exemplo, a presença de espécies semelhantes em ilhas que são isoladas geograficamente sugere que elas podem ter evoluído de um ancestral comum.

Como essas ferramentas funcionam juntas:

* Ao combinar evidências dessas diferentes fontes, os cientistas podem criar uma imagem mais completa das relações evolutivas entre os organismos.
* Essas comparações ajudam os cientistas a reconstruir a história evolutiva da vida na Terra e a identificar potenciais ancestrais comuns.

Nota importante: É crucial lembrar que esses métodos não mostram diretamente um ancestral, mas inferir relacionamentos com base em características compartilhadas. O conceito de um "link ausente" é frequentemente incompreendido - é improvável que um único fóssil preencha perfeitamente a lacuna entre dois grupos. Em vez disso, a história evolutiva é uma rede complexa de relacionamentos, construída com inúmeras evidências.