Você tem razão! A presença da lua no céu não está diretamente relacionada à formação de marés. Aqui está o porquê:

* marés são causadas pelo puxão gravitacional da lua (e do sol): A gravidade da lua puxa os oceanos da Terra, criando protuberâncias de água na lateral da terra voltadas para a lua e o lado oposto. É por isso que temos marés altas. O sol também exerce uma atração gravitacional, mas é mais fraca porque está muito mais longe.
* A posição da lua não importa para as marés: Se a lua é visível no céu ou não, sua atração gravitacional ainda está afetando os oceanos da Terra. A posição da lua em sua órbita ao redor da Terra influencia o momento e a força das marés, mas não a existência deles.

Pense assim: Você não pode ver a força da gravidade, mas ainda está agindo em você o tempo todo. O mesmo se aplica à atração gravitacional da lua nos oceanos.

Então, mesmo que a lua não seja visível pela manhã, sua gravidade ainda está puxando os oceanos da Terra, causando as marés.