p O dispositivo CFM de bancada, consistindo na própria unidade CFM (no topo), peças para transmitir o sinal da câmera, bem como uma bateria (à direita), cabe em dois baldes padrão de uma centrífuga de laboratório comum que são equilibrados por contrapesos nos respectivos baldes opostos. Crédito:Wyss Institute at Harvard University.
p Desde a tensão das fibras musculares em contração até os estresses hidrodinâmicos no fluxo sanguíneo, as moléculas dentro de nossos corpos estão sujeitas a uma ampla variedade de forças mecânicas que influenciam diretamente sua forma e função. Ao analisar as respostas de moléculas individuais sob condições em que experimentam tais forças, podemos desenvolver uma melhor compreensão de muitos processos biológicos, e potencialmente, desenvolver drogas de ação mais precisa. Mas até agora a análise experimental das interações de uma única molécula sob força eram caras, tedioso e difícil de executar porque requer o uso de equipamentos sofisticados, como um microscópio de força atômica ou pinças ópticas, que só permitem a análise de uma molécula de cada vez. p Agora, uma equipe de pesquisa liderada por Wesley Wong no Instituto Wyss de Engenharia Inspirada na Biologia de Harvard e no Hospital Infantil de Boston fez um grande avanço ao desenvolver um método barato que permite a análise das respostas de força de milhares de moléculas semelhantes simultaneamente. Eles relatam em
Nature Communications como nanointerruptores de DNA programáveis podem ser usados em combinação com um Microscópio de Força Centrífuga (CFM) miniaturizado recém-projetado como uma ferramenta altamente confiável para observar milhares de moléculas individuais e suas respostas às forças mecânicas em paralelo.
p "Esta nova abordagem combinada permitirá que nós e outros examinemos como os complexos de uma única molécula se comportam quando são lançados fora de seu equilíbrio pela força sintonizável gerada em nosso CFM recém-projetado. Baseando este instrumento em algo que a maioria dos pesquisadores já tem e usa - a centrífuga de bancada - esperamos fazer medições de força de uma única molécula acessíveis a quase todos, "disse Wong, Ph.D., que é membro do corpo docente associado do Wyss Institute e autor sênior do estudo. Ele também é professor assistente na Harvard Medical School nos Departamentos de Química Biológica e Farmacologia Molecular e Pediatria, e Investigadora do Programa de Medicina Celular e Molecular do Boston Children's Hospital.
p A imagem no topo mostra um nanointerruptor de DNA que forma uma estrutura em loop quando uma ligação é formada entre os componentes reativos anexados (por exemplo, par receptor-ligante mostrado em vermelho e verde); em uma extremidade, ele é preso ao estágio de amostra e, na outra, a um cordão (topo). Ao aplicar forças centrífugas ao cordão no dispositivo CFM, a ligação entre os componentes reativos pode ser rompida repetidamente, abrindo o loop e aumentando o comprimento da corda de DNA (parte inferior), permitindo medições altamente confiáveis de interações moleculares. No CFM, muitas contas podem ser interrogadas em paralelo, permitindo medições de molécula única de alto rendimento (canto inferior esquerdo). No vídeo no canto inferior direito, a câmera captura esses eventos de ruptura em tempo real, registrando o cordão em um ponto diferente. Crédito:Wyss Institute at Harvard University.
p Esforços anteriores liderados por Wong no Rowland Institute em Harvard introduziram o primeiro CFM em 2010, que era um instrumento altamente especializado que realizava medições de força de precisão de alto rendimento em moléculas individuais, amarrando-as a grânulos e puxando-as usando força centrífuga. Em sua última iteração CFM, Wong e sua equipe desenvolveram uma maneira de realizar a mesma técnica com precisão semelhante usando um pequeno microscópio barato feito de elementos fáceis de montar e peças impressas em 3D que podem ser inseridas no balde oscilante de uma centrífuga de bancada padrão encontrada em praticamente todos laboratórios de pesquisa biomédica.
p Além disso, a equipe aumentou a robustez e a precisão do ensaio integrando milhares dos chamados nanointerruptores de DNA, fitas lineares de DNA com pares de moléculas interagentes que estão associadas a duas sequências em seu meio e que, além do que, além do mais, ligando-se uns aos outros, criam um loop interno de DNA; as pontas dos nanointerruptores são amarradas à superfície da amostra de um lado e a contas do outro.
p "Ao aplicar uma gama definida de forças centrífugas às contas, podemos provocar a ruptura dos complexos moleculares gerando as estruturas de DNA em loop que serão registradas pela lente acoplada à câmera. usar nanointerruptores de DNA como um andaime estável nos permite repetir esse processo várias vezes com a mesma molécula em condições de temperatura controlada, o que aumenta muito nossa precisão na determinação da heterogeneidade que uma única interação molecular pode exibir, "disse Darren Yang, o primeiro autor do estudo e um estudante de graduação na equipe de Wong.
p Em pesquisas futuras, Nanointerruptores de DNA associados a esferas podem ser empregados para montar e romper repetidamente muitos complexos biomoleculares diferentes e para definir as forças mecânicas que os controlam. "Os nanointerruptores de DNA integrados são muito modulares, e pode ser funcionalizado com muitas biomoléculas diferentes essencialmente de forma plug-and-play, para permitir que uma ampla variedade de interações moleculares sejam estudadas com alto rendimento e confiabilidade, "acrescentou Wong.
p Próximo, os cientistas da Wyss estão planejando aplicar seu CFM em miniatura aprimorado por nanomutador de DNA à investigação de interações moleculares biomedicamente relevantes e dependentes de força, como as interações de proteínas que regem a coagulação do sangue ou a audição.
p "A equipe de Wong criou uma nova plataforma de tecnologia que reduz muito o custo da análise de força de uma única molécula e a torna amplamente acessível para a comunidade científica. Além de aumentar nossa compreensão das relações estrutura-função molecular básica, pode ser uma ferramenta valiosa para o desenvolvimento de medicamentos, "disse o Diretor Fundador do Wyss Institute, Donald Ingber, M.D., Ph.D., que também é o professor Judah Folkman de Biologia Vascular na Harvard Medical School e do programa de Biologia Vascular no Hospital Infantil de Boston, e Professor de Bioengenharia do SEAS.