Artigo mostra movimento controlado por enzima de polímero de DNA através de um nanopore
p Pesquisa publicada esta semana em
Nature Nanotechnology mostra um novo método de movimento controlado por enzima de uma única fita de DNA através de um nanoporo de proteína. O papel, por pesquisadores da University of California Santa Cruz (UCSC), representa um passo fundamental para o sequenciamento nanopore de fitas de DNA. p A publicação descreve a observação de DNA de fita simples (ssDNA) à medida que se transloca através de um nanoporo de proteína, alfa hemolisina (AHL). O movimento do ssDNA foi controlado pela replicação facilitada pela polimerase de moléculas de DNA individuais. Este movimento pode ser iniciado sob controle eletrônico. A atividade da polimerase mostrou ser bloqueada na solução quando o ssDNA não estava na abertura do nanopore, no entanto, a captura da fita pelo poro remove uma fita bloqueadora de nucleotídeos e permite que a polimerase funcione na fita presa.
p Os pesquisadores da UCSC estão colaborando com a Oxford Nanopore Technologies Ltd no desenvolvimento de uma nova geração de eletrônicos, tecnologia de sequenciamento de DNA de uma única molécula. No método de 'sequenciamento de fita', a corrente através de um nanopore é medida quando um polímero de DNA passa por esse poro. Mudanças nesta corrente são usadas para identificar as bases de DNA na molécula de DNA, em sequência. Este artigo aborda um desafio chave para o sequenciamento de fita de DNA:controle fino da translocação da fita de DNA através do nanopore, a uma taxa que é consistente e lenta o suficiente para permitir a identificação precisa de bases individuais de DNA. o
Nature Nanotechnology trabalho mostra pela primeira vez que o movimento de uma fita pode ser controlado usando feedback eletrônico e que uma enzima pode mover uma fita contra um campo enquanto está localizada no topo do nanopore.
p "As técnicas descritas neste artigo são um avanço em direção à eletrônica, sequenciamento de DNA de molécula única de fitas de DNA ", disse o investigador Professor Mark Akeson, da Universidade da Califórnia, Santa Cruz. "O controle eletrônico da translocação de DNA através de um nanopore de proteína é um objetivo científico pelo qual nos esforçamos por anos e esses métodos agora estão formando a base para trabalhos futuros em nossos laboratórios. Estamos entusiasmados com nossa colaboração com a Oxford Nanopore, cuja estratégia de detecção de nanopore paralelo é impressionante. "