As ligações de alta energia no ATP são encontradas entre os grupos fosfato .

Mais especificamente:

* entre o segundo e o terceiro grupos de fosfato: Essa ligação é a mais comumente chamada de "vínculo de alta energia" e é a que normalmente é quebrada quando o ATP é usado como fonte de energia.
* entre os grupos de primeiro e segundo fosfato: Essa ligação também armazena uma quantidade significativa de energia, mas normalmente não é quebrada durante o metabolismo celular normal.

Essas ligações são consideradas "alta energia" porque liberam uma quantidade significativa de energia quando são quebradas. Essa energia é então usada para alimentar vários processos celulares, como contração muscular, transmissão de impulso nervoso e síntese de proteínas.