Cientistas da Universidade de Aberdeen desenvolveram uma nova técnica que pode ajudar a identificar a fonte de intoxicação alimentar ou infecção com mais rapidez e precisão do que os métodos atuais.

Avanços no sequenciamento do genoma completo (WGS) significam que a sequência completa do DNA do genoma de um organismo pode ser obtida em um único momento.

Mas os métodos para extrair efetivamente essa riqueza de informações para fins de controle de infecção ainda não foram totalmente desenvolvidos.

Escrevendo no jornal Relatórios Científicos , os pesquisadores delinearam uma nova técnica que demonstraram poder combinar campylobacter e potencialmente outros patógenos alimentares comuns com mais precisão à sua fonte de origem dentro de um período de tempo significativamente reduzido.

A bactéria Campylobacter causa mais doenças de origem alimentar do que qualquer outro organismo, mas identificar onde um paciente adquiriu a infecção é muitas vezes difícil, pois pode se originar de vários reservatórios de animais, incluindo gado, frango, porcos, ovelhas e pássaros selvagens.

A técnica desenvolvida pelos cientistas da Aberdeen se baseia em um novo método de aprendizado de máquina - conhecido como método de distância multilocus mínima (MMD) - que pode ser usado para "treinar" um computador para identificar fontes prováveis ​​com um alto grau de precisão.

O estudo foi liderado pelo Dr. Francisco Perez Reche e Professor Norval Strachan, ambos dos departamentos de Física e Ciências Biológicas da University of Aberdeen.

O Dr. Perez Reche disse:"Existem vários métodos para calcular a provável origem de uma infecção, mas para funcionar de forma eficaz, eles usam apenas parte do sequenciamento do genoma, o que significa que os resultados são menos direcionados, ou se eles usam todo o genoma, os cálculos podem levar até dois dias para serem executados.

“Ao lidar com um surto de infecção, velocidade e precisão de identificação da fonte provável são fundamentais.

"Nosso método MMD treina o computador para identificar as fontes prováveis ​​de origem de uma infecção por Campylobacter em segundos."

O professor Strachan acrescentou:"Isso tem o potencial de fornecer rapidamente informações sobre a fonte potencial de infecção e pode ser usado para informar estratégias para reduzir a intoxicação alimentar."

A técnica foi demonstrada em um nível teórico, mas mais pesquisas serão necessárias para transformá-la em tecnologia que possa estar ao alcance dos profissionais de proteção à saúde.

Além de seu uso em intoxicações alimentares, os pesquisadores também examinaram como isso poderia ser aplicado à evolução humana combinando indivíduos com populações, para determinar a distribuição geográfica de diferentes espécies e para determinar o tipo de tumores de câncer de mama.