Muitas organelas são pequenas demais para serem observadas com um microscópio leve e requerem um microscópio eletrônico para visualização. Aqui estão alguns exemplos:

* ribossomos: Estas são as fábricas de síntese proteica da célula e são incrivelmente pequenas.
* retículo endoplasmático (er): Essa rede de membranas está envolvida na dobragem de proteínas e na síntese lipídica. Possui uma estrutura complexa difícil de resolver com um microscópio leve.
* Golgi Aparelho: Esta organela processa e empacota proteínas e lipídios para transporte. Sua estrutura intrincada é visível apenas com microscopia eletrônica.
* Mitocôndrias: Estas são as potências da célula, gerando energia através da respiração celular. Enquanto você pode ver mitocôndrias com um microscópio de luz muito poderoso, sua estrutura interna é visível apenas com um microscópio eletrônico.
* lisossomos: Essas organelas são responsáveis ​​por quebrar os resíduos e detritos celulares. Sua estrutura é pequena demais para ser vista claramente com um microscópio leve.
* peroxissomos: Essas organelas estão envolvidas em vários processos metabólicos, incluindo desintoxicação. Seu pequeno tamanho e estrutura requerem microscopia eletrônica.

Em essência, qualquer organela menor que o limite de resolução de um microscópio leve (aproximadamente 200 nanômetros) requer um microscópio eletrônico para visualização.