As sementes e os esporos são modos de reprodução encontrados em plantas, fungos e algumas bactérias. Nem todas as plantas produzem sementes como meio de reprodução. Plantas que não florescem, como samambaias, se reproduzem com o uso de esporos. Enquanto sementes e esporos produzem a próxima geração, as sementes são um modo de reprodução mais desenvolvido que oferece muitas vantagens.

TL; DR (muito tempo; não leu)

O revestimento das sementes oferece proteção e nutrição que não estão disponíveis para esporos. E os casacos de sementes contêm um embrião totalmente desenvolvido pronto para crescer, enquanto os esporos precisam passar por um processo de reprodução antes de estarem prontos para crescer.
O revestimento de sementes

O revestimento de sementes é uma grande vantagem das sementes sobre esporos. Um esporo é um organismo unicelular que se desenvolve em uma planta ou fungo quando as condições são adequadas. O esporo não tem proteção externa. Uma semente é um organismo multicelular com uma casca externa que protege o interior de danos, dessecação e outras condições adversas.

Cada semente contém alimento para o embrião dentro da semente. O endosperma é o tecido que envolve o embrião dentro da semente. O embrião usa a nutrição fornecida pelo endosperma como um salto para começar a crescer. O esporo, sendo um organismo unicelular, não possui um sistema interno para ajudar uma nova planta ou fungo a iniciar o processo de crescimento.
Embrião totalmente desenvolvido

Dentro de cada semente existe um embrião totalmente desenvolvido que está pronto para começar a crescer. Muitas sementes passam por um período de dormência, que é o período em que a semente não germina e começa a crescer. Quando as condições são adequadas, o embrião germina e começa a crescer. Ter um embrião já crescido dá a uma planta de sementes uma melhor chance de sobrevivência, em oposição a um esporo. A única célula do esporo deve passar por um processo de divisão e especialização celular antes que a planta ou o fungo possa realmente começar a crescer.
Não é necessária água

As sementes não precisam necessariamente de água para germinar e crescer, embora algumas precisa de água para amaciar o revestimento de sementes. Sementes grandes em condições secas reterão água e permitirão que a planta cresça raízes profundas sem a necessidade de chuva ou água adicional. No entanto, todos os esporos precisam de água antes de iniciar o processo de crescimento. Se as condições não estiverem exatamente corretas, o esporo não produzirá a próxima geração.