Existem algumas maneiras de dizer 0,000000003:

formal:

* três bilhões
* três vezes dez para o nono negativo (3 x 10⁻⁹)

Informal:

* ponto zero zero zero zero zero zero zero zero zero três (Isso é um pouco pesado, mas é tecnicamente preciso)

A melhor maneira de dizer que dependerá do contexto. Em um ambiente científico, as opções formais seriam mais apropriadas. Em uma conversa casual, a opção informal pode estar bem.