O esquilo obterá a maior quantidade de energia necessária para escapar durante a cadeia de transporte de elétrons, que é o estágio final da respiração celular.

Durante a cadeia de transporte de elétrons, elétrons de alta energia passam por uma série de complexos proteicos, liberando energia que é usada para bombear prótons através da membrana mitocondrial interna. Isto cria um gradiente de prótons, que impulsiona a síntese de trifosfato de adenosina (ATP), a moeda energética universal das células.

A cadeia de transporte de elétrons é altamente eficiente na geração de ATP e pode produzir até 34 moléculas de ATP para cada molécula de glicose que é decomposta durante a respiração celular. Este ATP rico em energia pode então ser usado pelos músculos do esquilo para impulsionar sua fuga, fornecendo a energia necessária para movimentos rápidos e rápidas explosões de velocidade.