Em um artigo publicado no Journal of Biological Chemistry , Dr. Özdemir estudou duas famílias de proteínas chamadas Rho GTPases e IQGAPs, que são conhecidos por desempenhar um papel importante na metástase do câncer. Essas duas famílias de proteínas "suspeitas" foram estudadas por muitos pesquisadores ao longo dos anos, mas a interação entre eles não havia sido totalmente compreendida.

É importante entender como a metástase, a propagação do câncer de seu local primário para outros órgãos, acontece em, uma vez que prevenir metástases significa manter o câncer sob controle. É por isso que o Dr. Özdemir escolheu estudar essas proteínas, que são conhecidos por ativar metástases.

Exigindo uma grande quantidade de cálculos probabilísticos, o estudo só foi possível por meio de técnicas de simulação computacional com o auxílio de computadores muito poderosos. Os pesquisadores construíram um ambiente de simulação em que muitos elementos, como a densidade da água na célula, os íons e a estrutura tridimensional das proteínas foram simulados com muita precisão. Isso possibilitou observar como exatamente as duas proteínas interagiam, os pontos em que eles ligam, e quais mudanças morfológicas a ligação causou nas proteínas.

A simulação durou seis meses. O estudo observou os pontos de ligação e a sequência das duas proteínas, como a grande proteína encontrou seu par, e como as duas estruturas complexas se unem. E foi estabelecido que as estruturas complexas que se formaram ativaram os mecanismos que desencadearam metástases nas células.

O estudo da Dra. Sıla Özdemir foi testado e replicado em células cancerosas em um laboratório por outro grupo de pesquisa do National Institutes of Health nos Estados Unidos (NIH), e os resultados mostraram uma correspondência exata:O experimento verificou os dados produzidos por meio de simulações de computador. O resultado mais importante desta descoberta será a sua contribuição para a concepção de um medicamento que tenha como alvo o mecanismo em questão.

Após sua publicação no Journal of Biological Chemistry , entre as revistas de maior prestígio na área, A pesquisa do Dr. Özdemir foi publicada como parte de uma coleção especial do jornal dos artigos mais influentes de 2018.