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    Novo site de código aberto apresenta projetos para dispositivos lab-on-a-chip
    p Metafluidics.org, um novo site de código aberto do MIT, fornece projetos para peças microfluídicas. Na foto, algumas fotos do site. Crédito:Metafluidics.org

    p Um novo site de código aberto projetado pelo MIT pode muito bem ser o Pinterest da microfluídica. O site, Metafluidics.org, é um repositório gratuito de projetos para dispositivos lab-on-a-chip, submetido por todos os tipos de inventores, incluindo cientistas e engenheiros treinados, amadores, alunos, e fabricantes amadores. Os usuários podem navegar no site para dispositivos que variam de classificadores de células simples e misturadores de fluidos, para chips mais complexos que analisam o fluido ocular e sintetizam sequências de genes. p O site também serve como uma plataforma social para a comunidade microfluídica:Qualquer usuário pode fazer login para enviar um design; eles também podem gostar, Comente no, e baixar arquivos de design para reproduzir um dispositivo em destaque ou melhorá-lo.

    p David S. Kong, diretor da nova Iniciativa Comunitária de Biotecnologia do MIT Media Lab, diz que o novo site foi projetado para acelerar a inovação em design microfluídico, que até agora tem seguido um convencional, rota avaliada por pares acadêmicos.

    p "Há uma experiência familiar para as pessoas da microfluídica:você vê um artigo realmente incrível que mostra um design, mas se você quiser tentar copiar o design, os arquivos de design reais que são uma parte crítica da reprodução ou remixagem de um dispositivo não são compartilhados de forma sistemática, "Kong diz." Como resultado, pesquisadores de todo o mundo estão em paralelo reinventando a roda. É uma das razões pelas quais o código-fonte aberto em geral é um conjunto de princípios muito poderoso. Pode realmente acelerar a difusão da tecnologia. "

    p Kong e seus colegas descreveram a plataforma de código aberto em um artigo publicado na semana passada na revista Nature Biotechnology . Seus co-autores são Todd Thorsen, Peter Carr, e Scott Wick, do Lincoln Laboratory do MIT; Jonathan Babb e Jeremy Gam, do Departamento de Engenharia Biológica; e Ron Weiss, professor de engenharia biológica e de engenharia elétrica e informática.

    p Um ecossistema aberto

    p Os pesquisadores modelaram seu site Metafluidics a partir de repositórios de código aberto populares, como GitHub - um site gratuito que hospeda projetos de software de código aberto - e Thingiverse, um site que apresenta arquivos de design de hardware para brinquedos criados por usuários, aparelhos, e robôs.

    p Kong teve a ideia da Metafluídica como biólogo sintético no Lincoln Laboratory, onde trabalhou para combinar fragmentos de DNA para reprogramar novas funções em células vivas. Para fazer isso, ele regularmente fazia uso de repositórios de DNA, como o GenBank do National Institutes of Health - um banco de dados disponível publicamente por meio do qual os cientistas podem compartilhar e acessar sequências genéticas e suas funções associadas.

    p "Tem havido bastante compartilhamento de diferentes tipos de informações em torno da biologia sintética, "Kong observa." Portanto, este tipo de movimento de código aberto mais amplo em biotecnologia é importante, e esperamos preencher essa parte fundamental do ecossistema que está especificamente relacionada ao hardware. "

    p Fichas de curadoria

    p A equipe trabalhou com a Bocoup, uma empresa de consultoria de software de código aberto, para projetar uma plataforma de código aberto para compartilhar projetos microfluídicos. Para acessar o site gratuito, os usuários preenchem um breve perfil para fazer login, depois disso, eles podem navegar pelos dispositivos apresentados ou pesquisar o site para funções microfluídicas específicas.

    p Cada dispositivo carregado para o site inclui uma breve descrição, junto com uma lista de materiais usados ​​para fabricar o chip, e seus arquivos de design associados, como desenhos de projeto auxiliado por computador (CAD).

    p "Microfluídica de papel, Chips de litografia 3-D impressos e macios, todas essas técnicas requerem esse arquivo de design digital, "Kong diz." Essa é a principal coisa que estamos disponibilizando pela primeira vez para a comunidade maior. "

    p Atualmente, o site está repleto de designs enviados por estudantes e entusiastas, juntamente com os principais especialistas na área, como Thorsen, que contribuiu com vários publicados anteriormente, dispositivos altamente citados e os projetos para reproduzi-los.

    p "Estamos alcançando os principais pioneiros e líderes em um campo mais amplo e fazendo a curadoria de coleções de seus arquivos de design, "Kong diz." Espero que isso inspire as pessoas a fazer a próxima geração de peças [microfluídicas]. "

    p O site é administrado por uma equipe editorial, incluindo Nina Wang, um estudante do segundo ano em engenharia biológica no MIT, e Kong, que está trabalhando para conscientizar a comunidade de microfluídica sobre o site. Eventualmente, conforme as pessoas carregam mais dispositivos, a equipe planeja destacar certos projetos como, por exemplo, uma "Parte da semana".

    p "Com o tempo, também queremos iniciar desafios:Quem pode fazer o classificador de partículas mais rápido? Quem pode fazer dispositivos que podem cultivar um certo tipo de micróbio intestinal?" Kong diz. "Minha opinião é que a inovação como um todo se beneficia quando você tem diversas comunidades envolvidas e há uma tremenda abertura."

    p Uma democracia microfluídica

    p Os pesquisadores enviaram um novo dispositivo ao site para demonstrar o potencial da plataforma de código aberto para uso em biologia sintética. Usando peças microfluídicas comuns e um controlador de código aberto, ou sistema de válvula, a equipe projetou um dispositivo de montagem de circuito genético - um chip que combina fragmentos de DNA automaticamente para formar uma nova sequência genética capaz de desempenhar uma nova função quando incorporada em uma célula viva.

    p "Nossa esperança é, demonstrando um aplicativo como DNA assembly com nosso sistema de código aberto, isso vai encorajar outros a reproduzir nosso sistema e remixá-lo para aplicativos que são fundamentais para a biologia sintética, "Kong diz.

    p Na visão de longo prazo, ele prevê que o site "democratizará" a microfluídica e iluminará novas ideias de fontes inesperadas.

    p “Temos uma grande mistura de peças, dos mais avançados pioneiros no campo, para alunos que estão fazendo microfluídica pela primeira vez, "Kong diz." Existe a possibilidade de algum estudante obscuro de alguma outra parte do mundo desenvolver seguidores, se a comunidade microfluídica achar que sua parte é interessante ou legal. " p Esta história foi republicada por cortesia do MIT News (web.mit.edu/newsoffice/), um site popular que cobre notícias sobre pesquisas do MIT, inovação e ensino.




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